农产品加工与贮藏工程学科团队长期以来坚持学科的发展与地方资源研究相结合、科学研究与企业需要相结合，紧紧围绕农产品深加工理论基础及质量控制、畜禽产品深加工及贮藏技术开展科学研究。面向新的农业科技革命，发展学科前沿适应市场竞争，服务农业现代化国家目标和区域经济；发挥自身优势，理论与技术、工艺与设备、工程与管理、科研攻关与人才培养相结合，形成了一定的学科特色。尤其在技术实用性方面，皖北地区农产品资源十分丰富，经济发展相对滞后，研究该地区农产品深加工及贮藏技术可为地区经济发展提供技术支撑，从而更好地推动运用区域资源优势发展地方经济。经过多年的学科发展，逐渐凝练成以下三个主要的教学和科研方向：

畜产品加工方向——研究畜禽肉类、乳品、蛋制品的加工工艺和新产品开发；微生物发酵类食品的加工与开发。

果蔬采后贮藏保鲜与加工方向——包括各种蔬菜水果的保鲜与加工技术及产业化开发。

农产品加工及贮藏工程方向——包括小麦、稻米、豆类、杂粮等谷物类食品深加工工艺。

学科确立以服务区域经济建设为宗旨，积极探索校企合作、产学研结合模式，努力建成一支具有较强产学研能力的学科团队。通过产学研的有机结合，及时解决了生产中出现的技术问题，同时利用我省农产品加工企业的产业优势反哺科研；通过不同科研机构间的学科交叉，促进技术创新。